自治体運営だから別に構わないのでは？
私の地域、かなりの田舎ですが今回の台風の避難場所は小学校とか中学校とか公民館とかだったから自治会関係なかった。
ただ、自治会から自治会会員に班長経由で避難場所の連絡とかあるから自治会に未加入だと自分で調べなきゃだからめんどくさいかもだけど。