小児慢性特定疾患の不正使用について、詳しい方医療事務関係の方教えてください。

自業自得なので厳しいお言葉は結構です。
ですがとても困っています。
現在子供が小児慢性特定疾患の対象になっていて去年使用開始し、今年で2年目になります。
保健所の方の説明は医療機関に受信する時に提示してくださいと言われ病院にかかった時も受付の方から受給者証出してくださいと毎回言われていた為何も知らずに提示していました。
ですが今日受給者証をよく見ると特定疾患以外の病気(喘息、入院など)には使えないと書いてありました。
今までよく受給者証を見ていなかった私が悪いのはもちろんですがこのままでは不正使用した分を返金することになるのでしょうか。
病院や薬局がどういう請求をしているかわかりませんがこれで正しい使用方法をしたとしてもいずれバレますでしょうか？
シングルマザーでやっと生計を立てているため返金だととても厳しいです。
病院や薬局は補助費を請求する際にこの薬がいくら分……などと細かく請求するのでしょうか、それともこの人が使った薬はトータルいくら分となるのでしょうか。
詳しい優しい回答お願いします。