現場で既に施工済みの部分の変更で、変更する事で取替が必要だったり、施工期間が延びたりしない程度なら言っても問題ないと思います。
図面の通りになっていない場合のクレームもありだと思う。

工務店？住宅メーカー？にしてもうるさいお客さんは沢山いるから、ちゃんと対応してくれるなら問題ないし、対応しない方が問題。

電気のスイッチとかコンセントとか、たまになんで？って感じの微妙な位置のズレとかあるから、現場で見るのは正解だと思うよ。