基礎体温の計測する時間について

現在、２人目子作り中でなかなかできないので、明日から基礎体温を付けようと思っているのですが、基礎体温は毎日大体同じ時間に計測しなきゃいけないですよね？ですが、子が朝方５時くらいから、起きたり寝たりと寝ぼけていて、私も目覚ましがなるまで、寝たり起きたりを繰り返しているのですが、こうゆう場合は、いつ計測するのがいいと思いますか？目覚ましがなって完全に目が覚めた時で、大丈夫だと思いますか？
長文、失礼します。