子どもさんが、書きたいものがあってその際使う色が黒だったのなら大丈夫だと思いますよ。
思いもなく ただやみくもに暗い色で殴り書きをしているようであれば様子をみた方が良いかもしれませんが、まだ年少さんであるのだし発達の段階だと思いますよ。