これは差別ではなく分けた方がいいと思う。
自分が小学生の頃、体育で障害児の子とペアだったんだけど、倒立をしてペアの子が支えるみたいな授業で私が倒立してもペアの子が支えてくれずに避けるから、何度も背中から落ちて、痛すぎたけど数日は我慢してて、でももう体育が嫌になってお母さんに泣きながら言ったことある。
先生も見てたのに助けてくれないし、親が連絡してくれたら、その子は倒立授業は誰ともペア組まないことになったよ。

障害児と言ってもさまざまだし、同じ授業でも大丈夫な科目もあれば、分けた方がいい科目もあると思う。