部屋は３つあればいいかなと思ってたのですが、今現在理想の間取りでは予算オーバーの新築しかありません。

リフォームできればいいのですが今はお金がありません。将来の為にリフォーム費用を貯めつつ、もし息子が建て替えしたいと言った時にそのお金を渡すのはどうですか？
もし一緒に住めないとなった時には、定年後にそこを売った金額で住めるような家を買う等…

もう若くはないので、住宅購入するのはギリギリかなと思っています。