夫が会社の従業員と和気あいあいとしてるのが腹立つ

私も「社長の奥さん」やってますが、みんなで和気あいあいしてますよ。
従業員とどういう関係になるのが正しいのかは会社によって違うでしょうが、

>私が会社へ行っても誰も挨拶すらしてくれません
というのもはあんまりですし、
>私がいる頃より楽しそうにすら見えます
は、気分悪いですね～

>私に以前はペコペコしてた
とのことですから、威圧感ありすぎたのかもしれませんね。

「社長の奥さん」というのは、難しい立場です。
私は「夫をフォローし、従業員たちに気持ちよく働いてもらえるように心を配る」役割だと思っています。

うーん…気分悪いかもだけど、働いてた時が威圧的で怖かったんじゃ？嫌われてたのかもしれないですね。