中学生の席替え

中学生の娘がいますが、ある特定の男子から心ない言葉をかけられたりいじめにあっていたことから少し不登校気味ですが、本人なりに頑張って登校しています。
そんな中、席替えで男子５人の班に娘1人だけの構成にされ、とても辛い思いをしてしまい、学校に行こうとすると吐き気や腹痛に襲われるようになりました。
他の班は女子1人になっていることはないですし、娘は男子と仲良くできるタイプではないので交友関係を鑑みての組み合わせではないです。娘以外の男子５人は仲がいい組み合わせで、娘だけ浮いていることを本人が自覚して苦しい思いをしています。
みなさんなら学校に相談しますか？
相談したい気持ちでいっぱいなのですが、過保護なのかと悩む部分もあり迷っています。