子供会が登校班を管理しているというより、登校班がそのまま子供会になってるってことでしょ？
うちは大規模マンションでマンション内で、登校班が６班あるけど、それがまるっとマンションの子供会になってるよ。だから、選択制で通学学区じゃない小学校に通ってる子（私立の子も）は子供会に入れないです。登校班が運営してるから。

そもそも、なんで子供会抜けたいの？お子さんが行事に参加したくないなら、参加しなきゃよいだけでは？
まさか、あなたがお手伝いをやりたくないから？