なんとなく「娘が馴染めないのは相談してるのに、女子1人のグループに配置する担任、配慮がない！」と暗に言いたいような感じがしますが、もう小６ですよね？
もし誰かと班分けで一緒になりたいなら、担任の配慮に期待するのではなく、普段から積極的に友達に声かけするとか誘うとか、自ら行動することもそろそろ必要なのでは？
そういう様子が見て取れたら、担任の班分けの際の考慮にも変化が出てくるのかも。

もちろん勇気がいることだとは思いますが、ここで担任に何とかしてもらっても、この先ずっと同じような悩みを娘さんが抱えていくような気がします。

まだまだ周りのみんなも人間関係の勉強中だと思います。
娘さんも勇気を出して頑張って！