学校行きたくない、お腹痛いと子供に言われたらどう対応すべき？

小学1年生の息子です。
3学期明けから学校行きたくないと言うようになりました。理由は勉強が難しいからだそうです。
行きたくないと言いながらもちゃんと毎朝行ってたのですが、今朝登校したと思ったら、学校嫌だ、お腹が痛いと言って家に戻ってきました。
一緒に行ってあげるから頑張って学校にいこう！と5分くらい説得して、最終的に、もういい！行けばいいんやろ！と怒って走りながら学校に行ってしまいました。

私も仕事があるので学校に行ってほしかったのですが、本当にこれでよかったのか…
休ませてあげたほうがよかったんじゃないか…
でも休ませたらで休み癖がつくんじゃないか…

親なのに正解がわかりません。
みなさんならどう対応されますか？