その女の子には女の子なりの気持ちがあるので、仲良くしろというのも難しいと思う。妹を触られたくないのも仕方がない。その女の子がちょっかいだされるかのが嫌だとアピールしてるのに、娘さんが引かないから叩かれたのでは？
主さんが娘さんに、その女の子に話しかけたり、赤ちゃんを触ったりしないように言い聞かせることができないなら、バス停を変えるのが一番穏便な方法だと思う。席もできれば離してもらった方がいいかも。
娘さんとその女の子のどちらが悪いわけでもない。そういう性格ってだけ。