疑問になった点が幾つかあります。
①シートベルトが固定されて動けないはずなのに、扉はしっかり閉まってるのは怪しいと思います。

3歳の幼児がシートベルトは逃れても、重い扉を閉める力は無いのでは…。
もし力があったとしたら、大きな音が聞こえるはずです。

②スマホで遊ばせてたとありましたが、興味がありながらスマホは手離せないと思います。

車のロックが掛かって無い車内に、幼児を見つけ見知らぬ犯人もしくは、顔見知りの犯人が連れ去った可能性が高いのでは。

今の時期は、手袋をしてれば証拠も無いかと。

ドライブレコーダーが設置してあれば、長男と誰かが映ってる可能性もあると思う。

元気な姿で戻ってとお祈りしてます。
子供の顔で癒されてる親は沢山います。