授業中のトイレ問題に悩んでいます

小2息子が居ます。
赤ちゃんの頃から便秘気味で、
トイレは（大）は毎朝は出ず。

朝は、3日に1回ぐらいの割合でトイレが出る状態でした。

1年生の内は、長くても五時間授業なので、
授業中トイレ（大）に立つことはありませんでした。

2年生の2学期から6時間授業があり、
夏休みあけから今まで2回、（大）のために
授業中席を立ったそうです。
先生から連絡が来たわけでなく、
自己申告です。

毎朝、20分は便座に座らせ、起床時に必ず水を飲ませてます。ビオフェルミンやヤクルトは幼稚園の時から飲ませていますが、朝の排便に効果なしです。

生理現象とはいえ、2回も授業中離席した事にたいして申し訳ないです。

とりあえず｢朝は30分便座に座らせる、給食のおかわりはしない（おかわりした日の6時間目にもよおす事が多いため）、中休み昼休みは必ずトイレに行く｣を徹底させますが、他に朝、大が出やすくなる方法ってありますか？？