「種痘」というワクチン接種による予防が極めて有効。感 染後でも4日以内であればワクチン接種は有効であるとさ れている。また化学療法を中心とする対症治療が確立され ている。

テロの危険
根絶されたために根絶後に予防接種を受けた人はおらず、 また予防接種を受けた人でも免疫の持続期間が一般的に5 ～10年といわれているため、現在では免疫を持っている人はほとんどない
そのため、生物兵器としてテロに流用された場合に大きな被害を出す危険が指摘されている。
ワシントン・ポストは、CIAが天然痘ウイルスのサンプルを隠 し持っているとみている国として、イラク（注：記事はイ ラク戦争前のもの）、北朝鮮、ロシア、フランスを挙げて いる（ただし、イラクとフランスについては可能性はとても高いというわけではないとしている）

類似ウイルス
天然痘ウイルスは根絶宣言が出されたが、類似したウイルスの危険性を指摘する研究者がいる。研究によれば、複数の身近な生物が類似ウイルスの宿主になりうることが示さ れており、それらが変異すると人類にとって脅威になるかもしれないと警告している