確かに数値の凸凹はギリギリ標準偏差内ですし、知能指数も平均範囲内ですね。
勉強が出来ないと言ってもテストで50点台をとったりはしないのではないでしょうか？
http://www.ed.niigata-u.ac.jp/~nagasawa/WISC.pdf
私は専門家では無いので詳しく説明は出来ませんが、こちらの35ページに各項目が何を指すのか記されているので参考までに。
(たぶんご存知かと思いますが念のため)

運動能力に関しては、作業療法士に見て頂きましたか？
うちの息子は運動能力にも不安を感じたのでウィスクの他に作業療法士に週に一度、何週間か様子を見て頂き、体幹が弱いとの診断が下されＯＴの訓練を受けています。
受けたからと言って劇的に運動能力が上がるということはありませんが、作業療法士からアドバイスを頂いたり相談に乗ってもらえるので、もしまだ未診断でしたら受診出来るか聞いてみる事をオススメします。