私だったら↓様に返信する。

大の大人の体調不良（副反応なんて皆んなあるもの）、で妻をわざわざ休ませるなんて世間から非常識呼ばわり、何も出来ず未だにママ(妻)に甘えているのかと陰口言われてしまうのは◯◯さん本人です。
私たち夫婦はそういう事も理解したうえで、本日の出勤に至りました。
そういった事も考慮されたうえでのこの様なメールでしょうか？
また、お母さんが◯◯さんの事がご心配で我が家の主婦である私の許可なく勝手に台所を使ったのは、致し方のない事とは思いますが、世間一般的にマザコンと思わせる行為は◯◯さんにとっても良い事ではありませんので、今後の行動・言動には、是非◯◯さんの事を慮って頂けると助かります。
今度ともよろしくお願いいたします。